Organiskos un neorganiskos pigmentus izšķir pēc to izcelsmes un ķīmiskajām īpašībām.
Avots: Organiskos pigmentus ekstrahē vai sintezē no dzīvniekiem, augiem, minerāliem vai mākslīgi sintezētiem organiskiem savienojumiem. Neorganiskos pigmentus ekstrahē vai sintezē no rūdām, minerāliem vai sintētiskiem neorganiskiem savienojumiem.
Ķīmiskās īpašības: organisko pigmentu molekulas parasti sastāv no sarežģītām struktūrām, kas satur oglekli, un to krāsu nosaka organiskā savienojuma ķīmiskā struktūra. Neorganisko pigmentu molekulas parasti sastāv no neorganiskiem elementiem, un to krāsu nosaka elementu īpašības un struktūra.
Stabilitāte: neorganiskie pigmenti parasti ir stabilāki nekā organiskie pigmenti un izturīgāki pret gaismu, skābēm, sārmiem un karstumu. Organiskie pigmenti noteiktos apstākļos var sadalīties vai mainīt krāsu. Krāsu diapazons: to ķīmiskās struktūras atšķirību dēļ organiskajiem pigmentiem parasti ir plašāks krāsu diapazons, kas ļauj iegūt košākas krāsas. Neorganiskajiem pigmentiem ir salīdzinoši šaurs krāsu diapazons. Pielietojuma jomas: Organiskie pigmenti ir piemēroti krāsvielām, krāsām, plastmasai, papīram un citām jomām. Neorganiskie pigmenti tiek plaši izmantoti keramikā, stiklā, pigmentos, pārklājumos un citās jomās.

Jāņem vērā, ka gan organiskajiem, gan neorganiskiem pigmentiem ir savas priekšrocības un īpašības, un izvēle, kuru pigmentu izmantot, ir atkarīga no konkrētajām pielietošanas vajadzībām un vēlamā efekta.